Los derechos de Indiana Jones son complicados.
Disney es la dueña de Lucasfilms, tiene los derechos del personaje, del merchandising y juguetes y de la distribución de la quinta y futuras películas/series. Paramount tiene los derechos de distribución de las 4 películas originales y de los productos derivados de esas como la serie, los videojuegos, comics, etc.
Disney/Marvel tal vez podría hacer comics nuevos ambientados en la quinta película, pero posiblemente no pueda recuperar los comics o hacer nuevos ambientados en las películas clásicas sin llegar a acuerdos (es decir, poner mucho dinero sobre la mesa) con Paramount.
En resumen, si no ha recuperado los cómics, es porque a día de hoy no sale al cuenta, no hay negocio o no les interesa. Si fuesen a ganar mucho dinero las dos empresas, seguro que se ponían de acuerdo.