Entiendo entonces que el problema es que no habrá spoilers de mensajes antiguos pero sí se podrá poner en los mensajes nuevos. ¿No?
De momento no se entiende nada, porque no se sabe ni como abordarlo

Pero lo más probable es que se "limpie" el código y BD, para que sea actualizable. Eso implica eliminar de esa base, todo el código realizado sobre el estándar, que entre el estaría lo de spoilers, porque se hizo "a mano" sobre el código. No estaría esa funcionalidad en una "versión limpia".
Simplificando, el foro funciona como un "traductor" (más bien interpretador), cuando llega a un texto especial (una etiqueta) lo interpreta en consecuencia (por ejemplo "[/spoiler]"). Sin esta funcionalidad las etiquetas de spoiler las vería como texto simple, ni para mensajes nuevos, ni para viejos (todo el texto lo interpreta el mismo código sin distinción de viejo/nuevo).
Pero vamos que es lo menos importante de todo. La clave es llegar a una versión estable y con actualizaciones, el resto ya se verá cuando toque... si toca.