Hmm, no, yo diría que no hay ningún spoiler de las Guerras Clon en todas las series de Star Wars y Darth Vader. En la segunda serie de Darth Vader, la de Dark Lord of the Sith, sí podrías encontrarte alguno de pasada, pero en la primera no. Recuerdo que había una pequeña subtrama sobre geonosianos que hacía referencia a las Guerras Clon y a Rebels, pero no me parece que pueda considerarse un spoiler en absoluto.
Bastante más adelante en la serie de Star Wars si podrías encontrarte a algún personaje de Rebels, lo que te revelará que no muere durante los eventos de esa serie, claro. Sin embargo, esto también fue hecho precisamente así a propósito, o sea, hay cómics de ésos que se publicaron antes de que terminara Rebels, supongo que para que te quedaras pensando "vale, este personaje sobrevive, pero, ¿y los demás? ¿Qué pasa con los demás?".