Sí, es curioso. Originalmente era Obi Wan quién iba a tomarla como padawan, pero él y Yoda se la adjudican a Anakin para modular su carácter o algo así.
No sé cual es la versión oficial sobre el destino de Ashoka, pero los rumores que más corren son:
1- La mata el general Grievous
2- Muere durante la purga de los jedi (Orden 66)
3- Sobrevive a la orden 66 y se une a la rebelión (y es cazada y eliminada por Darth Vader
Pero son solo rumores. No sé si la serie animada se sigue emitiendo o no, pero no se ha establecido un destino oficial al personaje por parte de Lucas.
Personalmente, la serie no me parece mala, ni el personaje tampoco, y no pasa nada relativamente importante que pueda afectar lo que se narra en el episodio III. Las guerras clon duran 3 años... Margen para hacer muchas cosas.