Pues sí, de hecho empezó allí, dibujando Alpha Flight. Después pasó por Punisher: War Journal para acabar en la Patrulla-X, lo quelo encumbró hasta tal punto que le dieron serie propia, X-Men. En un principio, con Claremont a los guiones, pero éste no aguantó las presiones editoriales y se largó después del tercero. Poco después, Lee se largó de Marvel junto a otros autores punteros de la casa para fundar Image. Poco a poco se fue retirando del dibujo y dedicándose sólo a tareas editoriales hasta que le vendió su parte del estudio, Wildstorm, a DC. Entonces se le vio dibujar Batman o Superman.