Lo del profesor Xavier es cierto, pero su "muerte" sólo se ha producido en La Era de Apocalipsis, mientras que aquí Odín, Thor y todos los dioses han estado muertos de verdad.
Y Fénix, y Gwen Stacy, y el Duende Verde, y como tú mismo dices, el propio Thor, Heindall y demás, y Kraven el cazador, y el Capitán Marvel, y Warlock, y Drácula, y (al tiempo) el Capitán América y...
Además, la muerte y resurrección de los dioses asgardianos no tiene nada de especial. Es algo propio de su naturaleza (eterno retorno, ciclos y esas cosas. Sí, Thor los rompió pero su retorno marca, una vez más, el inicio de los ciclos)