Para mí la diferencia es que La Nueva Patrulla X es un cómic que lleva adelante la historia de décadas de la Patrulla X; es totalmente central, no sólo para el momento actual, sino también para la propia historia de los mutantes.
Mientras que Lobezno y la Patrulla X, esté como esté, es una colección "lateral", más "a su bola", que se puede disfrutar por sí misma, pero que no es una parte tan importante de la historia central, ni afecta tanto al resto de colecciones.