Yo se de gente que los tiene sin embolsar y bueno, si los tienes guardados en cajas especiales y no los maltratas muchos, aguantan. Pero claro, para los más especialitos, entre los que me incluyo, con bolsas más cajas te aseguras que vayan a aguantar muchísimo tiempo prácticamente como el primer día.
También como te dice spiderchen, el tema de las cajas, si estás empezando, no deberías preocuparte. En mi caso por ejemplo no empecé a plantearme lo de las cajas hasta que me ví con una cantidad aproximada de 400 comics y no sabía dónde meterlos.
Y las bolsas, pues como dice oskarosa, embolsar 500 comics de un tirón es una castaña muy dura. Yo te recomendaría que los embolsaras, aunque te parezca un lío (aquí te ayudamos a aclararte sin problemas), y más adelante si sigue creciendo la colección y te quedas sin espacio, pues pases al tema de las cajas.
Espero haber servido de ayuda!