Básicamente porque la historia avanza un poco, no es tan repetitivo , los escenarios son mucho más atractivos y porque la introducción de los glifos es una pasada.
Además tienes que gestionar tu casa , desbloquear la armadura de Altair y cuentas con la opción de contratar gente que te será de gran ayuda.
Por lo que a mi respecta es muuuuucho mejor que el primero.