Yo no he leido Tierra X, así que igual no tengo razón, pero si es un flashback contado en una historia que se asienta en la continuidad presente, aunque ocurra en un futuro alternativo que no entre en continuidad, el flasback sí debería entrar en continuidad (como pasaba -o debío pasar- con el origen de Gambito contado en X-men: El fin).
Es decir, si se hace referencia a sucesos del pasado, aunque sea desde un futuro alternativo y no canónico, si ese futuro ocurre partiendo de la continuidad presente, tendría que contar, porque, de hecho, ese futuro tomaría en cuenta toda la continuidad establecida.
Espero haberme explicado bien.