no lo veo muy claro, porque naruto era un recien nacido cuando el cuarto que por cierto se llama minato murió mientras que pain ya tenía sus años, de hecho pain ya era un niño cuando jiraiya fue nombrado sennin y fue entrenado por este para manejar su rinnegan.
y no te fíes porque pain no se parece a naruto, ese cuerpo que usa parecido a naruto no es suyo, ninguno de sus 6 cuerpos es suyo, no se donde se habrá metido el suyo real o si lo abandonó pero el verdadero pain que se vió cuando era niño era moreno y con el pelo largo que le cubría sus ojos.