Con respecto al banner, está preparado para que se muestre en la parte inferior, y no sé si sería fácil adaptarlo para que se viera en un lateral, pero es que el principal problema no sería ése. Por una parte, la web con un banner sólo por un lado quedaría descompensada y eso la afearía mucho. Y por otro lado, no todo el mundo tiene monitores de formato panorámico y con elevadas resoluciones. Con una resolución normal o la web se quedaría muy estrecha, o tendríamos que desplazarnos horizontalmente para verla entera, lo cual sí que sería horrible.
Realmente a los únicos que puede incomodarles el banner actual es a aquellos que tenga un monotor panorámico y una resolución baja, y ese caso es un tanto raro, porque normalmente si tiene un monior de ese tipo, es que puedes ponerle una buena resolución a la pantalla.