No sé si te he entendido bien. La historia río de Invasión Secreta se recopila en un tomo de Poderosos Vengadores, otro de Nuevos Vengadores y el de Invasión Secreta (espero que no saquen el Front Line porque fue horrible y prescindible). Después viene el Reinado Oscuro con Nuevos Vengadores y los Oscuros. Poderosos van a su aire y no afectan a la trama hasta Asedio, pero su aparición aparece mejor recogida en Thunderbolts. Para seguir el RO no hacen falta los Poderosos Vengadores y la historia río se cierra con IS.
No sé si me he explicado bien.
Sobre Thunderbolts, un número con la etapa Ellis hará babear a más de uno. De hecho en aquella época Thunderbolts iban en grapa (toda una proeza). Es en esta colección donde se desarrolla más este Reinado Oscuro, pero no vendieron demasiado. Además, hicieron el salto a los Oscuros.
Guerreros Secretos no la veo en MD.