El punto de inicio de los Marvel Now Deluxe es un buen punto de inicio para entrar en la actualidad Marvel. Es cierto que habrá referencias a eventos anteriores, pero en Marvel eso es inevitable. Si te leas por ejemplo Imposibles Vengadores, habrá referencias a A vs X, que a su vez referencia "Dinastía de M", que a su vez referencia a "Vengadores Desunidos", que a su vez referencia un evento previo de los Vengadores Costa Oeste, que a su vez referencia a los Vengadores, que a su vez referencia... y así hasta los años 60.
De los que dices, probablemente los que me parezcan más adecuado para entrar son Imposibles Vengadores y (especialmente) Thor. Thor no hace referencia a casi nada previo y empieza a muy buen nivel. Imposibles Vengadores sí referencia eventos previos, pero no es especialmente necesario haberlos leídos (de hecho yo las etapas previas de Remender no había leído cuando leí Imposibles Vengadores y no noté que me faltara nada).
Yo el de la Patrulla X te lo desrecomendaría totalmente, y a mí Vengadores me encantó, pero igual sin tener casi nada de conocimiento previo del universo Marvel no te engancha como me enganchó a mí.
Esa etapa de Iron Man no conozco, así que no puedo decir nada de ella.