Yo es que no lo veo, la verdad. Pero bueno, revisando ahora veo que hay ejemplos para todos los lados, por lo que creo que es mejor unificar criterio.
Que yo recuerde, el criterio siempre ha sido el mismo. Es decir, el título de la portada es el título del cómic y el que se incluye en el apartado de Datos Generales. Después está el título de la tripa, el que suele aparecer en el principio de la historia con los créditos de los autores o en algún índice. En las grapas no siempre suele haber título, por lo que no se pone siempre, pero si se da el caso de que hay algún título, pues se debería de poner. Yo al menos lo he hecho así siempre y por lo que he visto no he sido el único. En el caso de los tomos es más sencillo, claro.
Después hay otros casos en los que el título del índice es diferente al de la tripa, o cuando solo se indica en el índice, por lo que se debe indicar en un comentario. O al menos yo creo que es un dato de interés, igual que si las portadas originales se sitúan delante da cada historia o al final en un tomo.